Après avoir rappelé les théories à l'origine des concepts évolutifs, les différentes hypothèses sur l'origine du vivant sont discutées. Ensuite sont présentés les événements moléculaires qui ont permis aux êtres vivants d'acquérir de nouvelles fonctions. Enfin, sont exposées les méthodes issues de la génomique permettant de comparer les espèces entre elles.